34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2580 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1103    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  90.79 
 
 		 543 aa  983    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  61.23 
 
 		 559 aa  624  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  57.92 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  55.84 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  52.73 
 
 		 542 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  54.65 
 
 		 560 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  29.23 
 
 		 580 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  26.32 
 
 		 592 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.9 
 
 		 470 aa  98.2  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  25.88 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.22 
 
 		 581 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  24.95 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  25.1 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  27.13 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  24.62 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.77 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  24.82 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  21.11 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  24.9 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  24.12 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  23.84 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  22.12 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  26.09 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  28.99 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  22.63 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  26.43 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  27.86 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  22.74 
 
 		 512 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  25.32 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  23.55 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  24.89 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  24.45 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>