46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4476 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  973    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  60.65 
 
 		 504 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  41.23 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  39 
 
 		 483 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  41.76 
 
 		 497 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  28.6 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  30.63 
 
 		 488 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  32.37 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  32.11 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  30.99 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  27.29 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  30.12 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  29.59 
 
 		 488 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  27.85 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  27.85 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  32.36 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  29.08 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  29.13 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  27.73 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  27.73 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  28.26 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  28.91 
 
 		 490 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  29.13 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  27.41 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  27.47 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  27.82 
 
 		 499 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  24.44 
 
 		 494 aa  113  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  31.09 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  26.88 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.7 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.49 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.3 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  24.62 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  25.67 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  26.64 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  26.32 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  23.48 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  24.57 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  25.2 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  25.2 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.01 
 
 		 560 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  24.12 
 
 		 543 aa  53.5  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  22.57 
 
 		 559 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.57 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  27.98 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  23.01 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>