43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1707 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  84.03 
 
 		 488 aa  863    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  85.04 
 
 		 487 aa  856    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  76.23 
 
 		 488 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1011    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  43.15 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  41.28 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  41.67 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  41.84 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  41.38 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  42.41 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  41.03 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  39.14 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  38.41 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  38.27 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  38.21 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  38.65 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  38.04 
 
 		 491 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  38.45 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  37.8 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  38.45 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  32.15 
 
 		 493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  31.46 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  30.63 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  29.1 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  29.04 
 
 		 497 aa  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  30.65 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  28.41 
 
 		 492 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  28.15 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  23.82 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  26.16 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  29.55 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  25.27 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  26.94 
 
 		 580 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.94 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  23.72 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.5 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  21.34 
 
 		 467 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  26.59 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  29.71 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  25.32 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  26.14 
 
 		 561 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  25.56 
 
 		 582 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  25 
 
 		 581 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>