26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0276 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  938    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  51.52 
 
 
444 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  25.99 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  26.61 
 
 
501 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  25.78 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  25.5 
 
 
499 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  26.64 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  26.14 
 
 
491 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  26.14 
 
 
491 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  25.7 
 
 
490 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  26.34 
 
 
490 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  27.04 
 
 
491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  25.94 
 
 
494 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  25.5 
 
 
490 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  36.72 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  24.34 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  25.1 
 
 
491 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  28.26 
 
 
501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  26.43 
 
 
391 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  28.51 
 
 
488 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  25.89 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  32.78 
 
 
487 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  26.16 
 
 
488 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  26.42 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  25.1 
 
 
512 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  28.24 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>