45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0639 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  89.38 
 
 
492 aa  876    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  67.44 
 
 
497 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  979    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  39 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  40.29 
 
 
504 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  29.1 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  30.6 
 
 
512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  31.11 
 
 
488 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  28.54 
 
 
493 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  27.63 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  29.74 
 
 
494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  29.2 
 
 
487 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  27.9 
 
 
488 aa  140  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  26.49 
 
 
501 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  26.98 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  26.46 
 
 
491 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  27.8 
 
 
499 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  26.56 
 
 
499 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  26.12 
 
 
494 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  25.53 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  25.12 
 
 
491 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  25.12 
 
 
491 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  26.29 
 
 
494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  25.06 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  25.29 
 
 
490 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
410 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  24.09 
 
 
491 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.76 
 
 
464 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  25.46 
 
 
490 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.32 
 
 
470 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  29.39 
 
 
580 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  27.63 
 
 
592 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.62 
 
 
581 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  25.57 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  25.45 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  26.16 
 
 
543 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  25.49 
 
 
559 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  27.13 
 
 
543 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  22.41 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  26.24 
 
 
582 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  26.48 
 
 
542 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  23.68 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  22.19 
 
 
512 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  24.36 
 
 
560 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  19.74 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>