34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3384 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  59.14 
 
 		 542 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1104    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  60.33 
 
 		 559 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  58.29 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  57.92 
 
 		 543 aa  618  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  54.49 
 
 		 549 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  51.12 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  31.21 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  29.46 
 
 		 580 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  28.35 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  26.2 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  22.52 
 
 		 581 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  26.8 
 
 		 561 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  23.43 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  24.51 
 
 		 467 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  23.43 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  22.4 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  23.68 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  26.92 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.67 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  25 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  24.9 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  25.2 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  28.35 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  25.38 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  23.37 
 
 		 492 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  27.17 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  25.86 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  25.97 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  22.76 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  21.83 
 
 		 499 aa  47.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  24.62 
 
 		 501 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  26.59 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>