30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3176 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1138    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  67.05 
 
 
549 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  56.15 
 
 
559 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  55.11 
 
 
543 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  54.03 
 
 
543 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  50.83 
 
 
540 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  47.91 
 
 
542 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  32.55 
 
 
580 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  29.06 
 
 
592 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  26.3 
 
 
464 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.78 
 
 
581 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.67 
 
 
470 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  23.86 
 
 
561 aa  93.6  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  23.16 
 
 
582 aa  87  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  24.43 
 
 
492 aa  60.8  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  25.67 
 
 
501 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  22.44 
 
 
497 aa  57.4  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  26.67 
 
 
501 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  28.92 
 
 
512 aa  55.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  26.61 
 
 
497 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  27.27 
 
 
494 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  26.01 
 
 
477 aa  55.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  26.67 
 
 
499 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  24.45 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  24.72 
 
 
448 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  27.6 
 
 
410 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  25.52 
 
 
499 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  23.74 
 
 
494 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  25.44 
 
 
504 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  24 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>