41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3312 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1201    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  51.92 
 
 
581 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  41.76 
 
 
561 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  25.18 
 
 
592 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  24.62 
 
 
580 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.45 
 
 
470 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  23.08 
 
 
560 aa  84  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  23.67 
 
 
542 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  23.11 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  26.38 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  24.74 
 
 
543 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  23.99 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  22.98 
 
 
559 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  23.01 
 
 
549 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  25.67 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.62 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  26.24 
 
 
483 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  26.25 
 
 
512 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  22.4 
 
 
540 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  30.63 
 
 
493 aa  57  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  28.48 
 
 
499 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  26.18 
 
 
501 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  29.45 
 
 
497 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  27.88 
 
 
501 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  27.81 
 
 
490 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  23.66 
 
 
497 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  27.81 
 
 
490 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  28.48 
 
 
490 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  25.56 
 
 
467 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  27.81 
 
 
494 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  27.07 
 
 
488 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  31.15 
 
 
491 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  31.15 
 
 
491 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  31.15 
 
 
491 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  31.15 
 
 
491 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  26.67 
 
 
499 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  25.56 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  26.32 
 
 
487 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  25.45 
 
 
491 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  34.62 
 
 
485 aa  43.9  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  25.56 
 
 
488 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>