45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1636 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  90.95 
 
 		 464 aa  866    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  953    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  26.74 
 
 		 580 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  27.52 
 
 		 592 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  27.39 
 
 		 549 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.24 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  28.17 
 
 		 542 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  24.94 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  28.35 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.4 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  25.73 
 
 		 501 aa  99.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  24.38 
 
 		 497 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  25.86 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.71 
 
 		 560 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  26.02 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  25.11 
 
 		 561 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  26.08 
 
 		 559 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  25.32 
 
 		 582 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  24.94 
 
 		 499 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  26.64 
 
 		 543 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  30.11 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  24.52 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  27.54 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  28.19 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  24.62 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  27.03 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  26.77 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  27.2 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  26.44 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  26.34 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  26.34 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  22.6 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  22.6 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  24.21 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  23.25 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  24.91 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  25.2 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  24.9 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  23.39 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  24.03 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  24.16 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  25 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  25.48 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  22.17 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  23.62 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>