39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3887 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  85.74 
 
 
494 aa  897    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  89 
 
 
491 aa  924    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  89.21 
 
 
491 aa  925    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  63.27 
 
 
499 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  89.21 
 
 
491 aa  925    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1018    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  63.29 
 
 
501 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  89.41 
 
 
491 aa  929    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  87.37 
 
 
490 aa  909    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  87.37 
 
 
490 aa  910    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  87.37 
 
 
490 aa  909    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  59.01 
 
 
499 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  60.55 
 
 
494 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  61.27 
 
 
497 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  58.38 
 
 
501 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  57.29 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  39.14 
 
 
488 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  39.72 
 
 
488 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  39.26 
 
 
488 aa  332  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  38.56 
 
 
487 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  30.94 
 
 
493 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  28.92 
 
 
512 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  27.41 
 
 
477 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  25.55 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  23.69 
 
 
497 aa  116  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  25.1 
 
 
455 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  24.09 
 
 
483 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  24.02 
 
 
492 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  25.51 
 
 
391 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  27.04 
 
 
444 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  23.95 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  22.7 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  23.25 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  27.27 
 
 
581 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  22.73 
 
 
561 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  23.68 
 
 
542 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  25.95 
 
 
543 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  25.45 
 
 
582 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.2 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>