19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0054 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  960    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  32.81 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  27.15 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  25.1 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  25.1 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  24.51 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  27.19 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  24.54 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  22.22 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  26.44 
 
 		 497 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  25.56 
 
 		 582 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  20.79 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  21.34 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  24 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  20.62 
 
 		 592 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  33.06 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  22.52 
 
 		 561 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  32.52 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>