28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2193 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  100 
 
 
592 aa  1212    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  44.08 
 
 
580 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  30.9 
 
 
549 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  31.21 
 
 
540 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  30.19 
 
 
560 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  29.01 
 
 
542 aa  200  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  28.57 
 
 
559 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  26.77 
 
 
543 aa  187  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  26.6 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  28.87 
 
 
470 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  25.18 
 
 
582 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  27.52 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  26.79 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.69 
 
 
581 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  27.49 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  28.57 
 
 
492 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  27.24 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  27.95 
 
 
504 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  26.32 
 
 
477 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4433  hypothetical protein  23.94 
 
 
549 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4454  hypothetical protein  23.94 
 
 
518 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  24.91 
 
 
501 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  31.68 
 
 
512 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4294  hypothetical protein  24.32 
 
 
583 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  26.03 
 
 
497 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  28.75 
 
 
493 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  20.74 
 
 
467 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  34.15 
 
 
485 aa  43.9  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>