42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1514 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  60.12 
 
 
540 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1106    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  55.72 
 
 
559 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  53.8 
 
 
543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  53.09 
 
 
543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  49.91 
 
 
549 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  48.59 
 
 
560 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  31.78 
 
 
580 aa  233  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  29.01 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  28.63 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  27.8 
 
 
470 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.26 
 
 
581 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  23.67 
 
 
582 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.27 
 
 
561 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  26.64 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  29.77 
 
 
501 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  30.16 
 
 
499 aa  60.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  26.48 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  25.49 
 
 
497 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  26.42 
 
 
497 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  26.12 
 
 
501 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  24.61 
 
 
499 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.98 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  28.89 
 
 
494 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  25.97 
 
 
488 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  22.03 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  26.28 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  24.9 
 
 
491 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  24.9 
 
 
491 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  24.9 
 
 
491 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  24.79 
 
 
504 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  23.72 
 
 
488 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  24.03 
 
 
488 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  25.26 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  25.79 
 
 
490 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  24.48 
 
 
491 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  26.84 
 
 
494 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  21.43 
 
 
448 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  23.68 
 
 
494 aa  47.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  25.26 
 
 
490 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  23.68 
 
 
491 aa  47  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  26.11 
 
 
512 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>