44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0116 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  80.6 
 
 		 501 aa  865    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  75.95 
 
 		 499 aa  823    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1034    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  65.31 
 
 		 494 aa  703    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  72.11 
 
 		 501 aa  779    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  66.53 
 
 		 494 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  66.8 
 
 		 499 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  61.27 
 
 		 491 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  59.71 
 
 		 494 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  60 
 
 		 491 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  59.79 
 
 		 491 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  59.79 
 
 		 491 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  59.79 
 
 		 491 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  59.09 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  58.88 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  59.09 
 
 		 490 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  41.88 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  42.41 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  41.46 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  42.03 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  31.83 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  32.3 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  29.59 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  28.01 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  26.42 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  27.98 
 
 		 504 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  26.72 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  30.59 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  26.43 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  28.4 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  24.2 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  30.11 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  27.78 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  26.32 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  22.78 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  26.29 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  26.42 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.58 
 
 		 581 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.61 
 
 		 560 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  29.45 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  24.37 
 
 		 543 aa  50.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  22.63 
 
 		 543 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  33.64 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  22.76 
 
 		 540 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>