38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0797 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  978    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  63.91 
 
 
512 aa  612  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  32.52 
 
 
488 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  33.53 
 
 
499 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  34 
 
 
501 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  31.6 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  32.26 
 
 
499 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  31.86 
 
 
497 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  30.99 
 
 
501 aa  203  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  32.56 
 
 
488 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  31.25 
 
 
494 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  29.52 
 
 
488 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  30.32 
 
 
491 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  31.06 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  31.06 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  31.06 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  31.85 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  31.06 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  30.62 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  29.92 
 
 
491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  30.95 
 
 
490 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  30.94 
 
 
491 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  30.41 
 
 
477 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  31.89 
 
 
504 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  28.8 
 
 
483 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  27.72 
 
 
492 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  28.8 
 
 
497 aa  149  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  35.11 
 
 
410 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  33.16 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  25.2 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.7 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  22.88 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  30.41 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  30.63 
 
 
582 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.31 
 
 
561 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  28.81 
 
 
581 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  29.03 
 
 
592 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  28.57 
 
 
580 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>