44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2348 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1022    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  63.91 
 
 
493 aa  612  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  31.7 
 
 
488 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  31.74 
 
 
499 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  33.54 
 
 
488 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  31.06 
 
 
501 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  31.56 
 
 
497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  31.08 
 
 
501 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  31.64 
 
 
494 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  30.5 
 
 
487 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  30.36 
 
 
499 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  29.94 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  29.69 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  29.3 
 
 
490 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  28.71 
 
 
490 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  28.54 
 
 
491 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  29.77 
 
 
494 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  28.8 
 
 
491 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  28.77 
 
 
494 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  28.25 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  28.28 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  28.28 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  31.1 
 
 
497 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  32.35 
 
 
477 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  30.39 
 
 
483 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  29.49 
 
 
492 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  30.36 
 
 
504 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  35.09 
 
 
410 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  27.54 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  26.19 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  25.19 
 
 
455 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  24.75 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  23.05 
 
 
391 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  23.43 
 
 
540 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  32.34 
 
 
580 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  25.13 
 
 
561 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  26.25 
 
 
582 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.31 
 
 
581 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  28.92 
 
 
560 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  27.22 
 
 
543 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  23.5 
 
 
559 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  31.65 
 
 
592 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  25.45 
 
 
542 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  27.06 
 
 
549 aa  43.5  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>