45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2194 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1035    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  60.65 
 
 		 477 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  41.41 
 
 		 492 aa  359  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  40.29 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  42.49 
 
 		 497 aa  342  7e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  30.39 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  32.39 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  30.65 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  31.16 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  31.28 
 
 		 488 aa  143  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  27.47 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  27.74 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  30.58 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  28.26 
 
 		 494 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  27.98 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  27.06 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  27.17 
 
 		 490 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  27.17 
 
 		 490 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  26.7 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  25.62 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  26.96 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  25.69 
 
 		 491 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  25.55 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  25.51 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  25.28 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  25.28 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  25.64 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  29.8 
 
 		 410 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  24.55 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.63 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  26.72 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  26.38 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.9 
 
 		 581 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2193  hypothetical protein  27.88 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  25.31 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  25 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  24.9 
 
 		 543 aa  57  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1341  hypothetical protein  23.81 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.49 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3738  hypothetical protein  21.34 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.99619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  24.79 
 
 		 542 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1845  hypothetical protein  26.01 
 
 		 549 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  23.57 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  25.44 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  21.79 
 
 		 448 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>