42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0209 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  65.17 
 
 		 501 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  68.76 
 
 		 499 aa  742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  65.31 
 
 		 497 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1032    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  65.31 
 
 		 501 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  64.56 
 
 		 494 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  71.94 
 
 		 499 aa  795    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  58.52 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  58.53 
 
 		 490 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  58.33 
 
 		 490 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  58.72 
 
 		 490 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  57.58 
 
 		 491 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  57.58 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  57.29 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  57.58 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  58.15 
 
 		 491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  41.03 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  40.04 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  39.71 
 
 		 487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  40.44 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  30.58 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  29.59 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  25.05 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  25.05 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  26.12 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  24.44 
 
 		 477 aa  113  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  25.64 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  23.22 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  23.39 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  29.41 
 
 		 444 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  26.44 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.77 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  25.1 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.73 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.04 
 
 		 561 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  24.4 
 
 		 581 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  25.97 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  23.74 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  26.84 
 
 		 542 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  25.29 
 
 		 580 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  24.58 
 
 		 543 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0054  hypothetical protein  32.52 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>