32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4054 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  100 
 
 		 410 aa  824    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  35.09 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  35.11 
 
 		 493 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  33.08 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  28.16 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  29.8 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  28.15 
 
 		 488 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  27.59 
 
 		 501 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  28.87 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  31.32 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  31.09 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  29.2 
 
 		 488 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  28.77 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  26.89 
 
 		 501 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  29.41 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  27.24 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  29.15 
 
 		 487 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  26.44 
 
 		 494 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  24.83 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  23.91 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  24.14 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  24.16 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  24.16 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  23.85 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  23.03 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  22.87 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  22.7 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  29.03 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  23.39 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.03 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.92 
 
 		 560 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  28.57 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>