41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3887 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  95.31 
 
 		 494 aa  985    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  86.76 
 
 		 491 aa  909    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  86.97 
 
 		 491 aa  909    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  86.97 
 
 		 491 aa  909    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  87.37 
 
 		 491 aa  909    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  63.29 
 
 		 501 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  87.17 
 
 		 491 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  98.37 
 
 		 490 aa  1003    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  98.78 
 
 		 490 aa  1007    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1018    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  61.96 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  61.39 
 
 		 494 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  57.62 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  58.53 
 
 		 494 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  56.69 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  58.88 
 
 		 497 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  38.21 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  38.24 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  38.45 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  38.76 
 
 		 487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  31.19 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  28.51 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  29.13 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  26.96 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  30.88 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  24.33 
 
 		 497 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  25.46 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  23.52 
 
 		 492 aa  106  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  27.22 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  28.12 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  23.03 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.44 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  25.25 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  30 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  23.36 
 
 		 448 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  27.81 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  24.42 
 
 		 543 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  24.43 
 
 		 561 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  25.79 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  24.89 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  29.73 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>