44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3691 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4685  hypothetical protein  63.29 
 
 		 494 aa  666    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4275  hypothetical protein  62.27 
 
 		 491 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0077  hypothetical protein  70.68 
 
 		 501 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.845659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4470  hypothetical protein  62.68 
 
 		 491 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4106  hypothetical protein  70.86 
 
 		 499 aa  771    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0116  hypothetical protein  72.11 
 
 		 497 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.496915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4330  hypothetical protein  62.68 
 
 		 491 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3887  hypothetical protein  63.29 
 
 		 491 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3691  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1043    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0069  hypothetical protein  62.68 
 
 		 491 aa  661    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0111  hypothetical protein  70.89 
 
 		 494 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.730395  normal  0.0470607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4090  hypothetical protein  62.88 
 
 		 490 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3925  hypothetical protein  68.43 
 
 		 499 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3982  hypothetical protein  63.08 
 
 		 490 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0209  hypothetical protein  65.31 
 
 		 494 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.226819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3887  hypothetical protein  63.29 
 
 		 490 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1438  hypothetical protein  45.29 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00290508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1707  hypothetical protein  43.15 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1426  hypothetical protein  43.9 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.662582  normal  0.094585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2938  hypothetical protein  42.95 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0797  hypothetical protein  33.95 
 
 		 493 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2348  hypothetical protein  31.13 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0740731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4476  hypothetical protein  28.6 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0228  hypothetical protein  26.45 
 
 		 497 aa  140  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2194  hypothetical protein  27.74 
 
 		 504 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000160893  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0672  hypothetical protein  26.13 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0639  hypothetical protein  26.49 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.560101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0276  hypothetical protein  27.45 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4054  aldo/keto reductase  27.59 
 
 		 410 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.512949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0793  hypothetical protein  29.69 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0762  hypothetical protein  25.29 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000752788  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1636  hypothetical protein  26.29 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000397659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2579  hypothetical protein  24.88 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4204  hypothetical protein  22.85 
 
 		 448 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0833  hypothetical protein  26.7 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3176  hypothetical protein  26.67 
 
 		 560 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1514  hypothetical protein  26.12 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000154767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3808  hypothetical protein  21.79 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356806  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0775  hypothetical protein  29.51 
 
 		 580 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3312  hypothetical protein  26.18 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248493  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2580  hypothetical protein  22.12 
 
 		 543 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1635  hypothetical protein  23.93 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3384  hypothetical protein  24.62 
 
 		 540 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  23.35 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>