More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0951 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0951  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  97.76 
 
 		 223 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  72.65 
 
 		 225 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  73.76 
 
 		 222 aa  325  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  69.06 
 
 		 227 aa  317  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  66.06 
 
 		 224 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  60 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 219 aa  274  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 219 aa  274  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  58.06 
 
 		 219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  58.06 
 
 		 227 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  57.47 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 226 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14310  Response regulator  59.01 
 
 		 226 aa  261  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0234  response regulator receiver  58.45 
 
 		 221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.79 
 
 		 239 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.79 
 
 		 239 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.79 
 
 		 239 aa  257  8e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 		 241 aa  256  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  57.85 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.91 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  53.81 
 
 		 239 aa  254  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  54.3 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  56.5 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  58.06 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.46 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.46 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.46 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.46 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.02 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.02 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.02 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  52.84 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1104  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.02 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  54.02 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  52.84 
 
 		 242 aa  247  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.57 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3962  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03764  two-component system regulatory protein  53.57 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3840  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3145  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 231 aa  221  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00258001  hitchhiker  0.000377263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  44.74 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  44.8 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  42.67 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  45.5 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.41 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 236 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.86 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 229 aa  191  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  44.89 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  41.7 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4255  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.97 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1059  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.346912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  41.77 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>