More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7339 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7339  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  323  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4546  hypothetical protein  55.88 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.019004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  43.62 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3060  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  59.02 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  42.99 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  56.06 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  41.58 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  53.85 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  46.38 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  55.07 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  45.07 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  47.76 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  55.22 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  47.76 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  49.28 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  43.06 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  55.26 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.45 
 
 		 70 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  56.92 
 
 		 79 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  47.37 
 
 		 83 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  53.97 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.92 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  47.13 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  44.71 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  61.54 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  49.3 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  45.33 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  50.72 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  45 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  43.75 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  45.31 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  53.95 
 
 		 95 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  45 
 
 		 87 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  54.1 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  44.59 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  43.33 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  51.43 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.1 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  44.12 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  54.1 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  49.28 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  41.89 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  41.89 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  45.59 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  44.59 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  54.1 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1473  hypothetical protein  65.22 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  46.05 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  46.05 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  46.27 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  48.57 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  54.1 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  48 
 
 		 91 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  41.1 
 
 		 73 aa  67  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  44.16 
 
 		 85 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  46.84 
 
 		 84 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  47.89 
 
 		 98 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  47.83 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  53.03 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  52.46 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  40.62 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  63.04 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  40.62 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  60.87 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  44.62 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  42.86 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  40.58 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>