More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4546 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4546  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.019004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7339  hypothetical protein  55.88 
 
 		 168 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  52.38 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  54.69 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  73.47 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  39.82 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  53.52 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  54.29 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  52.17 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  47.37 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38040  conserved hypothetical protein TIGR00278  52.63 
 
 		 100 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  54.55 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  55.56 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  44.94 
 
 		 86 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  46.15 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  47.89 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.62 
 
 		 105 aa  72  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 		 79 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 		 79 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  43.82 
 
 		 99 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  41.94 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  43.06 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  44.93 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  43.59 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  37.21 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  47.3 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  40.58 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 		 73 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  45.71 
 
 		 86 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  40.58 
 
 		 78 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.25 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  51.47 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  53.97 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.62 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4591  hypothetical protein  55.88 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00100327  hitchhiker  0.000364901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  45.16 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  45.95 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1473  hypothetical protein  43.43 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  46.97 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  41.33 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  46.77 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  49.23 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  42.03 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  46.77 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  51.52 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  46.34 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  44.62 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.24 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  47.83 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  43.06 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14190  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50.77 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  55.74 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  54.1 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  63.04 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  49.21 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  50.79 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  52.31 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  42.47 
 
 		 97 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.79 
 
 		 81 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  53.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  52.46 
 
 		 70 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 85 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>