More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7042 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7042  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  244  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  49.28 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  47.83 
 
 		 286 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  47.69 
 
 		 292 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  43.94 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  43.94 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  43.28 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  41.43 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  43.28 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  41.43 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2522  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  43.94 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  45.45 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  39.71 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  45.45 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  39.71 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  40.85 
 
 		 281 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  45.45 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  39.71 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  43.28 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  39.71 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  39.71 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  44.78 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  44.78 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  43.28 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  44.78 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  39.51 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  42.25 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  39.51 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  39.51 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  39.51 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  42.03 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  39.51 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2361  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202779  decreased coverage  0.0000189175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2030  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0158715  normal  0.0307665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0387  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0610  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2267  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21514  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4159  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2508  integrase, catalytic region  44.83 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2722  integrase catalytic subunit  38.57 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3135  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  47.14 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  47.14 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  39.71 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  38.24 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  39.71 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  38.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  47.14 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>