More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2508 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2508  integrase, catalytic region  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 294 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 294 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 294 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 294 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 294 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6766  Integrase catalytic region  43.94 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7042  hypothetical protein  44.83 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  41.27 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  38.03 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  39.44 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  35.53 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  35 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  35.53 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  35.53 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  35.53 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  35 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  35.53 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  35.53 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  38.81 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  38.03 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  38.03 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  38.81 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  35.53 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  40 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  40 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  40 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  38.03 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  39.68 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1619  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0064  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  37.88 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4648  integrase catalytic region  32.91 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0036  isrso14-transposase orfb  34.18 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0362356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  38.03 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0152  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 278 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 263 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 409 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 379 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 364 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 411 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  35 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  36.62 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 367 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 376 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 360 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 383 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 379 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1523  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1542  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1688  IS1404 transposase  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.722668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1715  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0670836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1793  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1818  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.961912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1837  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00170274  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1940  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2101  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  35.29 
 
 		 362 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1993  IS407A, transposase OrfB  32.91 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>