More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1519 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  100 
 
 
271 aa  567  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0317  hypothetical protein  60.14 
 
 
141 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  35.98 
 
 
290 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0064  integrase catalytic region  32.23 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1619  integrase catalytic region  32.23 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 
369 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 
369 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  30.74 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  32.34 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  32.34 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
273 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  32.34 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  33.18 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  31.2 
 
 
382 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  31.09 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  33.18 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 
294 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 
294 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 
294 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 
294 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 
294 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  31.44 
 
 
382 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  31.44 
 
 
382 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 
382 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  32.51 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  34.86 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  29.97 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  32.27 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  30.18 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  34.15 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  34.15 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  32.27 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  32.73 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  32.27 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
262 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
262 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
262 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
262 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  34.04 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  30.18 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  30.18 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  30.18 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  34.04 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  34.04 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
306 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
306 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
307 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
307 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  30.07 
 
 
306 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  31.07 
 
 
300 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  31.98 
 
 
325 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  29.68 
 
 
293 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  31.29 
 
 
291 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 
307 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 
288 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  29.08 
 
 
294 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6766  Integrase catalytic region  31.73 
 
 
295 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0121  Integrase catalytic region  28 
 
 
296 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.133865 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  29.08 
 
 
294 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  29.08 
 
 
294 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  29.08 
 
 
294 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  29.08 
 
 
294 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3606  Integrase catalytic region  28 
 
 
296 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.607148  normal  0.464703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  29.92 
 
 
274 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  27.11 
 
 
301 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  29.76 
 
 
291 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  29.73 
 
 
233 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>