More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0064 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1619  integrase catalytic region  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0064  integrase catalytic region  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  32.68 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  32.68 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  32.68 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  32.68 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  32.68 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  27.34 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  27.39 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  27.34 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1494  transposase  29.06 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.750811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  27.03 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  25.98 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  25.98 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  29.08 
 
 		 281 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  26.39 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  27.8 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  25.2 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  27.8 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  27.8 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  24.14 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  24.14 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  24.14 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  29.33 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  25.1 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  25.1 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  25.1 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  25.1 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2222  transposase  29.46 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  29.33 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  29.33 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  29.33 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  29.33 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  28.65 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  25.1 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0036  isrso14-transposase orfb  26.76 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0362356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  27.62 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  23.96 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  26.99 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  26.99 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  23.96 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  23.96 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  26.57 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  27.43 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  25.49 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  27.43 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  28.93 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  26.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  25.6 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  25.6 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  28.93 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  28.93 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0736  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  26.29 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>