More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6766 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6766  Integrase catalytic region  100 
 
 
295 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  30.07 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  30.07 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  30.07 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  30.07 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  30.07 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  32.47 
 
 
271 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  29.25 
 
 
347 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  29.03 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  29.03 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  29.03 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  29.03 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0687  Integrase catalytic region  28.57 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1319  Integrase catalytic region  28.63 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.586112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  28.01 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  29.25 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  28.1 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  28.1 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  28.1 
 
 
271 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  29.17 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
276 aa  87  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  26.79 
 
 
273 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  26.79 
 
 
289 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  27.78 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  27.55 
 
 
272 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  27.51 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  27.51 
 
 
282 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  26.74 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  26.74 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  27.01 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  27.01 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  26.78 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  26.78 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  26.78 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  26.37 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  26.74 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  26.74 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  24.83 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  24.83 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  24.83 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  24.83 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  24.83 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  26.37 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  26.37 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  26.37 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  26.37 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  26.37 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  26.54 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  26.37 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  26.37 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  26.01 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  26.01 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  26.01 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  26.01 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  27.13 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  25.36 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  25.36 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  25.36 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  26.01 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  26.37 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  29.11 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  26.01 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  26.18 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  26.37 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  26.01 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  24.63 
 
 
382 aa  79  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  23.55 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  23.55 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  23.55 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  24.28 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  27.62 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0649  Integrase catalytic region  26.09 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  22.6 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  26.57 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>