116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3635 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  276  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  78.1 
 
 
280 aa  180  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  73.39 
 
 
279 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  71.3 
 
 
252 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0569  hypothetical protein  70.37 
 
 
142 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2723  hypothetical protein  71.56 
 
 
144 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.979081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  71.57 
 
 
290 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  78.02 
 
 
182 aa  157  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  73.79 
 
 
306 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  75.96 
 
 
288 aa  154  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  64 
 
 
277 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  64 
 
 
279 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  62.86 
 
 
273 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  62.14 
 
 
279 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  62.5 
 
 
302 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4033  hypothetical protein  60.95 
 
 
123 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638059  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1531  hypothetical protein  57.94 
 
 
147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0233164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  58.42 
 
 
266 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  57.84 
 
 
266 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  54.9 
 
 
271 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  55.88 
 
 
268 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  55.88 
 
 
293 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  54.13 
 
 
270 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  57.01 
 
 
268 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  56.07 
 
 
288 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  59.62 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  57.94 
 
 
276 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  57.8 
 
 
266 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  57.58 
 
 
271 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  58.59 
 
 
268 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  57.01 
 
 
277 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  53.92 
 
 
275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  53.15 
 
 
267 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  54.81 
 
 
271 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  55.56 
 
 
269 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  53.47 
 
 
274 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  60 
 
 
266 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  52.38 
 
 
333 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  56.86 
 
 
283 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  56.44 
 
 
234 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  53.54 
 
 
267 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  55.45 
 
 
270 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  62.11 
 
 
283 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  54.55 
 
 
286 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  54.72 
 
 
268 aa  121  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  53.47 
 
 
262 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  53.85 
 
 
268 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  47.2 
 
 
269 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  53.47 
 
 
262 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  54.55 
 
 
267 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  50.96 
 
 
263 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  57.69 
 
 
279 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  59.79 
 
 
271 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  55.45 
 
 
266 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  51.4 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  54.63 
 
 
280 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  52.34 
 
 
272 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  52.68 
 
 
266 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  56.73 
 
 
265 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  55.24 
 
 
264 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  53.68 
 
 
274 aa  116  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  50 
 
 
328 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  50.48 
 
 
284 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  53.12 
 
 
272 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  50.47 
 
 
284 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  53.54 
 
 
253 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  50.46 
 
 
284 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  50 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  54.29 
 
 
277 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  47.12 
 
 
265 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  57.43 
 
 
276 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  57.69 
 
 
277 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  47.66 
 
 
270 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  46.09 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  49.07 
 
 
276 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  50.47 
 
 
271 aa  110  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  47.79 
 
 
283 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  47.66 
 
 
285 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  50 
 
 
269 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  47.66 
 
 
268 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  50.51 
 
 
267 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  48.6 
 
 
283 aa  106  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  46.73 
 
 
277 aa  105  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  50.49 
 
 
266 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  51.96 
 
 
263 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  46.73 
 
 
269 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  47.66 
 
 
272 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  51.96 
 
 
268 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  48.6 
 
 
323 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  44.86 
 
 
278 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  51.04 
 
 
273 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  44.86 
 
 
278 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  45.71 
 
 
277 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  42.02 
 
 
274 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  49.48 
 
 
277 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  44.86 
 
 
282 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  48.96 
 
 
267 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  46.3 
 
 
278 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  55.21 
 
 
271 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>