More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4556 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.13 
 
 
270 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.46 
 
 
274 aa  351  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.41 
 
 
272 aa  347  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.6 
 
 
268 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.67 
 
 
278 aa  285  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 
274 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
268 aa  222  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
269 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
269 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4517  ABC transporter, permease  48.85 
 
 
268 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4923  ABC transporter, permease protein  48.85 
 
 
268 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4902  ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 
268 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4677  ABC transporter permease  48.47 
 
 
268 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4536  ABC transporter, permease  48.47 
 
 
268 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5038  ABC transporter permease  48.47 
 
 
268 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4937  ABC transporter, permease protein  48.09 
 
 
268 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0335  ABC transporter, permease protein  48.85 
 
 
268 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4903  ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 
268 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 
268 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
271 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
292 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
276 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
276 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
295 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
280 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.97 
 
 
287 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
287 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
257 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
282 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.22 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
293 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
285 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  31.58 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
246 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.74 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  30.14 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.28 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  31.91 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  30.38 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  27.97 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
283 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
329 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
270 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  27.16 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
263 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
255 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
255 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2062  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.58 
 
 
280 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.332807  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  26.41 
 
 
287 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.12 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.51 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  28.29 
 
 
263 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  30.7 
 
 
257 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 
254 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 
257 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  32.41 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  32.41 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  31.94 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  32.41 
 
 
257 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 
264 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
256 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
302 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  30.33 
 
 
286 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
254 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  28.64 
 
 
275 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
263 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>