More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0493 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.07 
 
 		 287 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.91 
 
 		 287 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  85.16 
 
 		 285 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.51 
 
 		 285 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.87 
 
 		 285 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.27 
 
 		 282 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.92 
 
 		 282 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.81 
 
 		 285 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.81 
 
 		 285 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  87.21 
 
 		 259 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 285 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  89.24 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.97 
 
 		 295 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.81 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.73 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.45 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.33 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  57.84 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.28 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.12 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  46.69 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  45.61 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.3 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.4 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 		 266 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  47.39 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  49.11 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.27 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 		 271 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 		 279 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  34.47 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4517  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4923  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4677  ABC transporter permease  32.91 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4536  ABC transporter, permease  32.91 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5038  ABC transporter permease  32.91 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4902  ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4937  ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0335  ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4903  ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  33.45 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 		 246 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.98 
 
 		 259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.98 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.6 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>