68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2439 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  25.58 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  23.43 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.98 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.51 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  32.61 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  22.68 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 		 523 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.04 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  35.16 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.27 
 
 		 520 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  22.94 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.5 
 
 		 506 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.36 
 
 		 522 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.89 
 
 		 519 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  23.17 
 
 		 522 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  26.14 
 
 		 421 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  24.55 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  32.94 
 
 		 143 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 546 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.42 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 518 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  23.67 
 
 		 535 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  30.34 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  25.79 
 
 		 449 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  20.48 
 
 		 442 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  31.87 
 
 		 141 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  31.87 
 
 		 141 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  24.84 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 552 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.17 
 
 		 521 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.35 
 
 		 484 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.35 
 
 		 484 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  29.21 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.85 
 
 		 523 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  23.59 
 
 		 539 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.93 
 
 		 665 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  21.74 
 
 		 526 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  23.42 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  23.42 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  22.94 
 
 		 523 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.68 
 
 		 488 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  25.9 
 
 		 644 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  30.61 
 
 		 500 aa  46.6  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  30 
 
 		 525 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  30 
 
 		 525 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  22.94 
 
 		 526 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.41 
 
 		 527 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 		 441 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  30.93 
 
 		 489 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.7 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.7 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.7 
 
 		 528 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.48 
 
 		 494 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.52 
 
 		 540 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  30.86 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  31.94 
 
 		 534 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  25 
 
 		 532 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  29.87 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 522 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  24.39 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.41 
 
 		 515 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24 
 
 		 479 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  32.89 
 
 		 738 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.55 
 
 		 613 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 		 494 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  26.74 
 
 		 545 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  21.7 
 
 		 522 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>