23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1608 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  100 
 
 		 151 aa  315  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  52.55 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  53.28 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  53.15 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  44.93 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  33.33 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  27.93 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  32.61 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 		 519 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.43 
 
 		 475 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  23.21 
 
 		 549 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 449 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 449 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  26.32 
 
 		 449 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  22.3 
 
 		 553 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  30.21 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  25.23 
 
 		 532 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.81 
 
 		 526 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.33 
 
 		 447 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>