21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2815 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  100 
 
 
137 aa  278  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  94.89 
 
 
149 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  59.56 
 
 
141 aa  169  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  59.56 
 
 
141 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  57.66 
 
 
143 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  53.28 
 
 
151 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  48.18 
 
 
138 aa  136  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  37.39 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  32.67 
 
 
326 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  30.34 
 
 
297 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  31.68 
 
 
498 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1233  Recombinase  30.19 
 
 
469 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.2 
 
 
553 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28.57 
 
 
421 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.42 
 
 
519 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  27.97 
 
 
447 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.55 
 
 
462 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3120  recombinase  33.66 
 
 
430 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  28.83 
 
 
526 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  33.75 
 
 
513 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  32.32 
 
 
441 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>