23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1068 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  51.82 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  51.82 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  50.36 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  48.18 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  48.18 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  44.93 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  33.33 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  31.73 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  35.16 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  33.66 
 
 		 441 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  30.28 
 
 		 441 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24 
 
 		 553 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  30 
 
 		 441 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  23.3 
 
 		 449 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  31.73 
 
 		 445 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.43 
 
 		 500 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  28.21 
 
 		 343 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.43 
 
 		 489 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22 
 
 		 449 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22 
 
 		 449 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.13 
 
 		 462 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>