27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1273 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  62.5 
 
 
149 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  59.56 
 
 
137 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  52.94 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  51.82 
 
 
138 aa  148  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  50 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  34.23 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  34.65 
 
 
326 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  31.87 
 
 
297 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  40.51 
 
 
518 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.05 
 
 
553 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  39.24 
 
 
513 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.97 
 
 
462 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  28 
 
 
421 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  37.97 
 
 
523 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.39 
 
 
442 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  37.97 
 
 
523 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
444 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  27.13 
 
 
430 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  26.88 
 
 
210 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.33 
 
 
552 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  34.57 
 
 
431 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  37.88 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 
441 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 
519 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0394  hypothetical protein  29.89 
 
 
201 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>