17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1670 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1670  recombinase  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2815  Recombinase  57.66 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.066428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0418  hypothetical protein  55.47 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1273  recombinase  52.94 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0283876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1611  recombinase  52.94 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1608  recombinase  53.15 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0140607  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1068  phage integrase family site specific recombinase  48.18 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  36.8 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  32.26 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2439  Recombinase  32.94 
 
 		 297 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  40.28 
 
 		 518 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  28.93 
 
 		 447 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3888  Recombinase  26.61 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.142462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  28.32 
 
 		 622 aa  42  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  29.59 
 
 		 443 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 441 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  29.9 
 
 		 421 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>