More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1104 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1104  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  618  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1831  transcriptional regulator, LysR family  29.61 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  24.84 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  24.57 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  26.01 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  26.01 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  26.01 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  26.01 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4632  LysR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  26.01 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  27.6 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  26.46 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  23.66 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  24.56 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  24.56 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  24.32 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  25.68 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  21.22 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4467  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0400691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  25.85 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3299  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0793122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  22.45 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  23.08 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  22.44 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9122  transcriptional regulator LysR family  26.83 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>