101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0485 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0485  Tail Collar domain protein  100 
 
 
82 aa  167  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  51.28 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  51.85 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  47.56 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  43.04 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  46.05 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  46.05 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  45.12 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  48.1 
 
 
82 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2492  Tail Collar domain protein  42.35 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  46.05 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  44.12 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  44.83 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  39.47 
 
 
181 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  36.25 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  38.89 
 
 
199 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  36.71 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  40 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  43.1 
 
 
195 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  39.71 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  34.72 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  37.68 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  41.54 
 
 
203 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  36.71 
 
 
183 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  37.88 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  38.89 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  34.15 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  37.18 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  42.11 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  44.23 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  40 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0753  phage tail collar domain-containing protein  42.31 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0792659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  36.11 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  43.86 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  38.81 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  35.53 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  38.24 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  38.24 
 
 
196 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  38.24 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  40.91 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  42.31 
 
 
175 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  38.98 
 
 
170 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  35.14 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  37.93 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  41.07 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  36.49 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  40.38 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  37.14 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  32.31 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  38.98 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  43.4 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  39.44 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  35.94 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  37.5 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  37.29 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2389  Collagen triple helix repeat  41.07 
 
 
201 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  42.37 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2477  Collagen triple helix repeat protein  41.07 
 
 
207 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  47.17 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  40.68 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  31.51 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  33.82 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  32.2 
 
 
246 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  35 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  36.36 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  38.98 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  41.51 
 
 
173 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  37.5 
 
 
189 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  37.5 
 
 
189 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  39.29 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  38.89 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  33.9 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  34.72 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  33.33 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  35.53 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  37.93 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  42.11 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  37.04 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  36.76 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  35.71 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  35.59 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  33.85 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  36.84 
 
 
501 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  34.38 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  32.35 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  36.21 
 
 
209 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  30.56 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  40.74 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0873  Tail Collar domain protein  32.93 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.379708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  35.59 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  35.59 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  35.71 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>