120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0269 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  54.43 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  49.37 
 
 		 87 aa  83.6  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  49.37 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  49.38 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  47.5 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  49.35 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  58.93 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  57.14 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  58.18 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  56.36 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  54.39 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  53.57 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  56.36 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  43.37 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  57.14 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 199 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 199 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  56.14 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  43.04 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  51.79 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  53.57 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  57.89 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  50.88 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  52.24 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  52.63 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  55.36 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  51.79 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  53.57 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  54.55 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  54.39 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  54.55 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  53.57 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  53.57 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  53.57 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  51.79 
 
 		 176 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  41.77 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  51.79 
 
 		 173 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  48.28 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  41.46 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  50 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  46.43 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  48.21 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  49.18 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  53.57 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  45.61 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  48.21 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  50 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  50.85 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  49.12 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  48.33 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  50 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  46.67 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  44.64 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  50.91 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  47.37 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  45.61 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  47.37 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  48.28 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  52.63 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  49.12 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  54.17 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  49.09 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  45 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  42.86 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  49.09 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  46.43 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  40.79 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  52.08 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  50.94 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  48.21 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  49.06 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  49.12 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  47.17 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  48.21 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  48.21 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  43.4 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  47.37 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  43.86 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0753  phage tail collar domain-containing protein  50.62 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0792659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0485  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  43.86 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  43.1 
 
 		 368 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2477  Collagen triple helix repeat protein  42.86 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  43.64 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2389  Collagen triple helix repeat  42.86 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  46.25 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  43.86 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  42.62 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  32.93 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  38.03 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  48.21 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>