108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2492 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2492  Tail Collar domain protein  100 
 
 
84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  51.85 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  46.91 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  40.24 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  48.15 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  45.12 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  41.77 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  41.56 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  46.55 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  51.72 
 
 
198 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  42.65 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  40.48 
 
 
80 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  48.28 
 
 
199 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  44.83 
 
 
205 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  50 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  50 
 
 
192 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  46.55 
 
 
175 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  50 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  51.85 
 
 
195 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  48.28 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  39.73 
 
 
173 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  46.55 
 
 
173 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  47.62 
 
 
172 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  48.28 
 
 
211 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0485  Tail Collar domain protein  42.35 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  48.15 
 
 
182 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  40 
 
 
199 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  40 
 
 
199 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  44.83 
 
 
173 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  49.09 
 
 
180 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  40 
 
 
199 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  44.83 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  45.61 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  41.54 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  46.55 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  40.51 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  40 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  42.65 
 
 
206 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  39.71 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  43.1 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  37.93 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  44.83 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  44.83 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  38.24 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  45.45 
 
 
181 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  41.07 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  46.55 
 
 
195 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  39.66 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  39.66 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
179 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  39.51 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  48.15 
 
 
195 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  46.3 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  45.61 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  37.93 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  39.66 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  41.82 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  37.14 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  32 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  39.66 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  41.38 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  43.64 
 
 
199 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  41.38 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  42.59 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  39.66 
 
 
175 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  37.93 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  35.44 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  41.82 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  40.74 
 
 
173 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  43.1 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  40.74 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  43.1 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  41.38 
 
 
210 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  39.66 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  44.44 
 
 
179 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  36.51 
 
 
184 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  44.83 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  37.93 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0873  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.379708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0753  phage tail collar domain-containing protein  41.03 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0792659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  38.71 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  36.84 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  41.67 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  38.89 
 
 
195 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  40.74 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  38.89 
 
 
178 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  41.38 
 
 
196 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  40.74 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>