133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0753 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0753  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 82 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0792659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  75.31 
 
 		 82 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  54.32 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  52.44 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  58.82 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 84 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  48.78 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  56.45 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  56.67 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  49.38 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  53.23 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  47.56 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  51.9 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  46.51 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  51.56 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  47.56 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  55.56 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  50.62 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  59.02 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  45.68 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  57.14 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  47.06 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  56.25 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  53.12 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  53.85 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  50.79 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  47.69 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  48.44 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  48.44 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  48.44 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  50 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  47.69 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  52.38 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  54.69 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  55.56 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  45.59 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  51.56 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  53.12 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  51.56 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  50 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  50.79 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  56.36 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  47.54 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  42.5 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  51.61 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  51.61 
 
 		 181 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  52.38 
 
 		 183 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  53.97 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  46.97 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  51.61 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  53.09 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  53.23 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  50.7 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  43.55 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  51.47 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  46.88 
 
 		 179 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  46.03 
 
 		 198 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  47.62 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  54.39 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  47.62 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  45.31 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  48.39 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  50.79 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  46.88 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  47.62 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  49.23 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  46.88 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  51.61 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  48.44 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  46.03 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  52.63 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  46.03 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  51.67 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  50 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  44.62 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  43.75 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0873  Tail Collar domain protein  40.66 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.379708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  46.67 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  46.03 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  46.03 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  42.19 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  43.75 
 
 		 173 aa  67  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  49.12 
 
 		 175 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  38.37 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  51.72 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  49.12 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  51.85 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  43.55 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2492  Tail Collar domain protein  41.03 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  40.74 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0485  Tail Collar domain protein  44.87 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  38.46 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>