More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1008 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1008  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 358 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 365 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.01 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  28.62 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  27.22 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.39 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  28.53 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.24 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  29.65 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  29.6 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  27.81 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  26.96 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  25.98 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.31 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  28.28 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.71 
 
 		 514 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.27 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.85 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.85 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.53 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.05 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.88 
 
 		 321 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.24 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.28 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.48 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.48 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  26.41 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  27.09 
 
 		 300 aa  96.7  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  25.15 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  26.13 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.31 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.44 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.31 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.31 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.31 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  29.31 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.84 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.88 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.43 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.87 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.87 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.87 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2390  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  28.87 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.91 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.28 
 
 		 310 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.29 
 
 		 304 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  27.38 
 
 		 307 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  27.88 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  27.16 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  26.17 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.01 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.71 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.01 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  25.55 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.32 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.32 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.88 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.32 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>