More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2390 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2390  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 306 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  66.12 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  66.56 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  70.29 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  70.29 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  65.46 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  68.36 
 
 		 300 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  68.36 
 
 		 300 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  68.73 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  68.36 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3595  periplasmic solute binding protein  63.18 
 
 		 306 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.235856 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  48.84 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  50.18 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  48.92 
 
 		 307 aa  288  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1248  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.83 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.36 
 
 		 322 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.99 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  27.35 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.18 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  28.42 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.34 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.19 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.6 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  25.33 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.49 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  29.87 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  25.34 
 
 		 280 aa  92.4  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.28 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.41 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  22.3 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  22.34 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  23.51 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.1 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.1 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  22.56 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.1 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.95 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  25.1 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.1 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.1 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.71 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.47 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  31.25 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  23.27 
 
 		 506 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  21.94 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  21.94 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  27.35 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  25.35 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.68 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  24.71 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  26.55 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  26.55 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  24.03 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  22.48 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  28.76 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  26.64 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  24.03 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  24.18 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  24.18 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>