More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1248 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1248  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 297 aa  586  1e-166  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  38.32 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  37.96 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.15 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  36.86 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  36.86 
 
 		 317 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  35.69 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  35.43 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2390  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3595  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.235856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.5 
 
 		 322 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.22 
 
 		 323 aa  95.5  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  26.35 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.4 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  21.76 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.75 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.62 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  23.91 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  22.71 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  24.35 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  20.98 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.15 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.64 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  20.22 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  22.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  22.78 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  28.63 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.98 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.32 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  25.47 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  24.17 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  25.47 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  24.1 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.8 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  20.78 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  24.79 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  23.19 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  24.08 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  24.26 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  24.26 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  24.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  20.85 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  22.43 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.38 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  24.15 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  20.79 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  22.85 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  23.67 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.74 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  23.41 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  24.1 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  21.98 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  21.77 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  23.72 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  22.92 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  20.31 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  24.81 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  25.33 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  22.54 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  24.84 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  21.65 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  22.46 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  26.07 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  20.91 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  24.39 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  25.51 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  20 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  24.26 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  22.46 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>