More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3595 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3595  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.235856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  62.75 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  63.51 
 
 		 300 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  63.85 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  63.51 
 
 		 300 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  63.51 
 
 		 300 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  61.87 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  65.96 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  65.96 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  63.73 
 
 		 300 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2390  twin-arginine translocation pathway signal  64.31 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  43.96 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  45.74 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  43.81 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1248  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.75 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  24.04 
 
 		 328 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.29 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.11 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.2 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.34 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  24.09 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  22.34 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  24.7 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  28.34 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  24.51 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.57 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.43 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  23.72 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  26.38 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.72 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  23.72 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  27.38 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  23.72 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.72 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  23.36 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.36 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  24.13 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  27.88 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  23.36 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  25.44 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  22.97 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  25.11 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.46 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.3 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  27.23 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  24.89 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  21.58 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.37 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  21.11 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  24.19 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  24.7 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  26.27 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  24.19 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  23.53 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  25.86 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  23.77 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  21.48 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.87 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  21.48 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.29 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  23.71 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  22.48 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  22.86 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  24.43 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  22.82 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  23.2 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  21.74 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  22.81 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  22.09 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  24.79 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  21.78 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  23.32 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  21.68 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25.3 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>