More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3754 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  100 
 
 		 114 aa  227  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 114 aa  160  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 115 aa  150  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 114 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 114 aa  148  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  48.67 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0686  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.499897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  50.91 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  49.56 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  51.82 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1191  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  50.88 
 
 		 117 aa  116  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2154  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000435469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  50.91 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  51.89 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  47.37 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0348  ribosomal protein L20  50.93 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000203448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  53.4 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  50.91 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  50.88 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  49.54 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  47.71 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  47.79 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  48.18 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0188  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.608699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  48.18 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  51.96 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  47.37 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  48.18 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  48.18 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  49.5 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  49.52 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>