More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1645 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  80.7 
 
 		 114 aa  186  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  73.68 
 
 		 114 aa  171  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  73.68 
 
 		 114 aa  170  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  74.56 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  71.93 
 
 		 114 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  71.93 
 
 		 114 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  69.03 
 
 		 114 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  67.54 
 
 		 115 aa  156  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  54.39 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  53.04 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  54.05 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  60.38 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  53.51 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 133 aa  121  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  54.39 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>