More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0620 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  230  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  66.96 
 
 		 115 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 114 aa  154  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  65.77 
 
 		 115 aa  154  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  62.83 
 
 		 114 aa  154  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 114 aa  153  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 114 aa  150  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  60.55 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  63.73 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.82 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.82 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  62.73 
 
 		 118 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  60.91 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  60.91 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 115 aa  133  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  59.63 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  56.88 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  63.3 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  59.63 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  59.09 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  54.13 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  55.65 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  59.43 
 
 		 116 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  56.36 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  52.29 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  127  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  56.36 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  52.73 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>